به منظور برنامه ریزی ، هدایت، سیاستگذاری، هماهنگی و نظارت در حوزه امور اجرایی مبارزه با قاچاق کالا و ارز ستادی ‌تحت عنوان ستاد مرکزی مبارزه با قاچاق متشکل از وزیر کشور (‌رییس ستاد)، وزیر اطلاعات، وزیر امور اقتصادی و دارایی ، وزیر بازرگانی ، وزیر راه و ترابری ، رییس کل بانک مرکزی ، فرمانده نیروی انتظامی جمهوری اسلامی ایران ، رییس کل گمرک ، مدیر عامل شرکت دخانیات ایران ، رییس سازمان جمع آوری و فروش اموال تملیکی ، رییس سازمان تعزیرات حکومتی یا نمایندگان تام الاختیار هر یک از آنها و نماینده تام الاختیار قوه قضاییه تشکیل می‌گردد.
‌تبصره -1 در صورت لزوم از سایر دستگاهها و کارشناسان امر حسب مورد دعوت خواهد شد.
‌تبصره 2 – دبیرخانه ستاد در وزارت کشور مستقر خواهد بود و تشکیلات سازمانی آن توسط وزیر کشور به تصویب خواهد رسید.
‌تبصره3 – کمیسیون مبارزه با قاچاق در استانها به ریاست استاندار یا معاون سیاسی و امنیتی وی و با عضویت فرمانده ناحیه انتظامی، رییس کل دادگستری، مدیران کل اطلاعات ، امور اقتصادی و دارایی، گمرک ، دخانیات و سازمان تعزیرات حکومتی هر ماهه تشکیل می‌گردد.

ستاد مرکزی مبارزه با قاچاق کالا و ارز زیرمجموعه نهاد ریاست‌جمهوری است که ریاست آن با عنوان نماینده ویژه رئیس جمهوری و رییس ستاد مرکزی مبارزه با قاچاق کالا و ارز منصوب می‌شود. این ستاد در پی صدور فرمان مقام معظم رهبری برای مبارزه با قاچاق و اقتصاد پنهان در تیرماه سال ۱۳۸۱ تاسیس شد.